gaussian-filter

ruby-filter-gaussian

概要

ガウシアンフィルターの Ruby 拡張。データが複数の場合は並列計算を行うため高速に計算されます。

基本的には、 https://docs.scipy.org/doc/scipy/reference/generated/scipy.ndimage.gaussian_filter1d.html と同じです。

• フィルターの標準偏差に対してデータが小さい場合は計算できません。
• 実装が異なるためか Python のライブラリと比較すると丸目誤差が存在する場合があります。誤差の大きさは 10^(-15) 程度です。

インストール

GitHub から、ruby-filter-gaussian をインストールするには以下のコマンドを実行します。

gem install specific_install
gem specific_install -l himeyama/ruby-filter-gaussian

Gemfile に記述する場合は以下のようにして bundle。

gem "gaussian-filter", github: "himeyama/ruby-filter-gaussian.git", branch: :main

使用法

Gaussian.filter1d(ary, sd) -> Array

データへガウシアンフィルター処理を行います。 `ary` の大きさが1の場合、1次元配列が返ります。 `ary` の大きさが2以上で `sd` が数値の場合は全てのデーターで `sd` が適応され、 `sd` が配列の場合は各データのインデックスに対応します。

[PARAM] ary:

一次元のデータ

[PARAM] sd:

ガウシアンフィルターの標準偏差。

require "Gaussian"

Gaussian.filter1d [1, 2, 3, 4, 5], 1
#=> [1.4270409503911738, 2.0678220347792573, 3.0, 3.932177965220743, 4.572959049608826]

Gaussian.filter1d [[1, 2, 3, 4, 5], [3, 2, 3, 4, 1]], 1
# => 
# [[1.4270409503911738, 2.0678220347792573, 3.0, 3.932177965220743, 4.572959049608826],
#  [2.708335457918112, 2.641484411955284, 2.8831540219185285, 2.757459057400815, 2.0095670508072625]]

Gaussian.filter1d [[1, 2, 3, 4, 5], [1, 2, 3, 4, 5]], [1, 0.5]
#=> 
# [[1.4270409503911738, 2.0678220347792573, 3.0, 3.932177965220743, 4.572959049608826],
#  [1.1072423672218035, 2.0002638650827373, 2.9999999999999996, 3.999736134917262, 4.892757632778196]]